اين معاونت نيز نقش اساسي در تأمين اعتبارات مالي و تنظيم هزينه‌هاي دانشگاه را بر عهده دارد. از اين رو يكي از وظايف آن پيش‌بيني‌هاي لازم و دقيق در مورد هزينه‌ها و تنظيم منابع درآمد و اشراف كامل بر نحوة هزينه كردن بودجه و ايجاد تعامل درآمدها است. این معاونت درراستای اهداف دانشگاه دو وظیفه اصلی را برعهده دارد.